"Why 〜?" と "How come 〜?" はどちらも「どうして、なぜ〜?」という表現になります。ただし、本文内の主語と述語が "Why are you" と "How come you are" のように逆になるので、注意が必要です。
"act up" は「(子供が)行儀良くしない、暴れる、騒ぐ」ということを表します。
"carry on" は「騒ぐ、暴れる」という表現になります。
この場合、次のような言い方ができますよ。
ーWhat are you so excited about?
「何をそんなに興奮してるの?」
ーWhat are you all worked up about?
「何をそんなに興奮してるの?」
子供が暴れてることに対しては excited や worked up を使うと良いと思います。
ご参考まで!