ーI flew to Dubai, but only in transit.
「ドバイにはトランジットで行っただけです」
to fly to ... で「…に飛行機で行く」
in transit で「トランジットで」
ーI had a stopover in Dubai on route to Paris, but I didn't leave the airport.
「パリに行く途中ドバイで乗り換えたが、空港から出なかった」
stopover は「途中下車」
on route to ... で「…に行く途中」
ご参考まで！
I only went to Dubai airport for a layover; I didn't leave the airport.
"only went to Dubai airport" は「ドバイの空港に行っただけ」ということで、旅行先ではなく単なる中継地点であったことを示します。
"for a layover" は「乗り継ぎのために」という意味です。
"I didn't leave the airport" は「空港の外には出なかった」ということで、空港内に留まっていたことを明確に伝えています。
カナダ 
アメリカ合衆国 
