ご質問ありがとうございます。
・You were supposed to be 〇〇.
＝「あなたは〇〇しているはずなのに。」
（例文）You were supposed to be studying.
（訳）あなたは勉強しているはずなのに。
・I thought you'd be 〇〇.
＝「〇〇していると思っていました。」
（例文）I thought you'd be studying today.
（訳）今日勉強していると思っていました。
（例文）I thought you'd be studying at home tonight. Why weren't you home?
（訳）今晩家で勉強していると思っていました。何故家にいなかったのですか？
お役に立てれば嬉しいです。
Coco
「あなたはその時～しているはずなのに」というフレーズを英語で表現するには、 "You were supposed to be doing ～ at that time." が適切です。"be supposed to" は「～することになっている」や「～するはずだった」という意味があります。
"at that time" が「その時」を指し、"doing ～" の部分に具体的な行動を入れることで、「～しているはずだったのに」という意味になります。
日本 
アメリカ合衆国 
