こんにちは！
ご質問ありがとうございます。
『What have you been doing here? とWhat are you doing here?は何が違いますか？』について、
１．
What have you been doing here?
は、『過去のある時点から今までここで何をしていますか？』という意味です。例えば、
What have you been doing here since last week?
とすると、
『先週から（今まで）ここで何をしていますか？』となります。
２．
What are you doing here?
は、『今ここで何をしていますか？』となります。
上記2つの大きく違うところは、１は、過去のある時点から現時点までのことを指しているのに対して、２は、現時点（今）のみを指していますね！
参考になれば幸いです。
一般的に What are you doing here? と現在形で表現します。このフレーズは「今まさにここで何をしているのか」を尋ねたいときに使われます。
役に立ちそうな単語とフレーズ
What are you up to?（何をしているんですか？）
What were you doing?（何をしていたのですか？）
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